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Une étude saisonnière (été - automne) de la biomasse microphytoplanctonique couplée aux facteurs environnementaux a été réalisée au niveau de quatre bassins de salinité croissante (A5, A16, C4-1, M2) de la saline de Sfax. Les résultats obtenus au cours de cette étude soulignent l’importance de la salinité dans la structuration des communautés microphytoplanctoniques. Les valeurs de la biomasse du microphytoplancton montrent une grande amplitude de variations durant la saison automnale puisqu’elles fluctuent de 23,47 µgC l^-1 (au niveau du bassin M2) à 753,35 µgC l^-1 (au niveau du bassin C4-1). Des faibles biomasses du microphytoplancton ont été enregistrées durant la saison estivale (min=35,89 – max=293,48 µgC l^-1) au niveau des bassins C4-1 et A5 respectivement. L’étude de la composition spécifique du microphytoplancton nous a permis d’identifier 68 genres et/ou espèces appartenant à cinq classes à savoir les diatomées, dinoflagellés, cyanobactéries, chlorophycées et euglénophycées. Les diatomées et les dinoflagellés représentent plus de 80% de la biomasse microphytoplanctonique totale au niveau des bassins A5, A16 et C4-1. On note nette dominance des diatomées pennées (Navicula sp. et Nitzschia sp.). Pour les dinoflagellés, ce sont surtout Gymnodinium sp., Prorocentrum micans, Ackashiwo sanguinea et Peridinium sp. qui prolifèrent. Au niveau du bassin hypersalé (M2), les cyanobactéries (Oscillatoria salina, Aphanothece halophytica, Phormidium versicolor et Spirulina subsalsa) et les chlorophycées (Chlamydomonas rubrifilum et Dunaliella salina) montrent les biomasses les plus élevées 49% pour les cyanobactéries et 16% pour les chlorophycées durant l’automne. Nous avons enregistré une nette variation spatiale et saisonnière des communautés microphytoplanctoniques et on a noté que la richesse spécifique et la biomasse diminuent avec le gradient croissant de salinité.